「3次元図形作図」コマンドで作成した、直方体・多角柱・多角錘・球・半球・壁・床・柱と、
「3次元化」の引き伸ばし・回転体・パイプで3次元化した図形は、自動的にパッケージ化されます。
「穴ポリゴン分解」コマンドはパッケージ内部の穴ポリゴンは分解しません。
したがって上記図形に編集を加える場合は、一旦パッケージを解除する必要があります。
「図形操作」メニューの「パッケージ解除」で、パッケージを解除してから、「3次元化」メニューの「穴ポリゴン分解」を行ってください。