2次元で作成していた円・円弧は、たて起こすと3Dポリラインに変換されます。
しかし立て起こした線分円・円弧(3Dポリライン)は線分の集まりなので、「円中心スナップ」では中心にはスナップできなくなります。
かわりに、「面重心スナップ」モードをご利用ください。

「面重心スナップ」モードは閉じたポリラインの重心にスナップするモードなので、線分円弧の中心にはスナップできません。
3次元編集モードで使用できる「面重心」・「面垂直」スナップは3次元図形が対象です。
線分円が2次元図形のままでは、スナップしませんのでご注意ください。
「線分操作」メニューの「3次元変換」コマンドで3次元図形に変換してください。あるいは「3次元化」メニューの「立て起し」コマンドなどで3次元化した図形は、自動的に3次元図形となります。