基礎計算条件で基礎下端レベル(GL-)があり、杭基礎生成条件でも基礎下端レベル(GL-)があり、基礎レベルでも基礎下端レベル(GL-)があり、何度も入力しないとしなければならないのでしょうか?

「基礎計算条件」基礎下端レベル(GL-):杭及び基礎の断面計算([計算]-[基礎構造計算])
「杭基礎生成条件」基礎下端レベル(GL-):杭基礎自動生成計算(必要杭本数算定計算)
で各々使用します。
「基礎底レベル個別入力」でのDf(「GL-」の記述はありませんので、GLより下の場合はマイナス値での入力が必要です)は一部の基礎の基礎底レベルが他の基礎の基礎底レベルと異なる場合に使用します。