基礎重量個別入力はそれぞれ入力しないといけないのでしょうか?

必ずしも入力する必要はありません。
基礎位置に「基礎重量の個別入力」が配置されている場合、その位置の基礎重量は「基礎重量の個別入力」で入力した値を使用します。
基礎位置に「基礎重量の個別入力」が配置されていない場合、「基礎計算条件」中で設定している「基礎下端レベル」及び「土被り上端までの距離」により基礎重量(基礎自重+土被り重量)を自動計算します。