一括変換では、線の色を設定することはできません。 DRA-CAD8から追加された「ドキュメントパレット」を使用すると、JWW形式への一括変換で線の色設定が可能です。

ドキュメントパレット上で、変換したいファイルを一つのカテゴリに登録していただきます。
JWW形式に変換したいファイルにチェックを入れます。
変換したいファイル名の上で右クリックして表示されるメニューの「ファイル形式を変換」を選択します。

変換先ファイルの保存場所を指定してから実行すると、[名前を付けて保存]の際に表示される設定ダイアログが表示されます。